Bioinformatik: metoder og anvendelse

Kursets hovedformål er at formidle grundlæggende principper og anvendelsesmuligheder af bioinformatiske metoder. Kurset er bygget op omkring eksempler på elementer fra relevante forskningsområder, og hvordan bioinformatiske værktøjer kan understøtte arbejdet.

Der lægges vægt på hands-on erfaring og kritisk vurdering af valg og brug af metoderne, herunder anvender data herfra. De studerende lærer at bruge bioinformatik til at finde løsninger og kvalificere resultaterne.

Når kurset er færdigt forventes den studerende at:

Viden:

• Have viden om og kunne søge information i eksisterende DNA, RNA- og proteinstrukturdatabaser og genome browsers
• Have forståelse for principperne bag bioinformatiske værktøjer og databaser
• Have viden om RNA- og proteinstruktur
• Kende principper for klassifikation af proteiners 3D strukturer og -modellering
• Have viden om genomics og transcriptomics 

Færdigheder:

• Kunne vurdere kvalitet af bioinformatiske data
• Vurdere valg af input data og digitale værktøjer og forholde sig kritisk til output data
• Udforske enzymfamilier og deres slægtskab
• Kunne fremstille 3D-protein strukturer baseret på computerbaseret komparativ modellering
• Skal kunne udføre genomanalyser og søge efter regulatoriske DNA motiver og elementer
• Kunne bruge analyser af multigen familer, herunder fylogeni og bioteknologisk relevante enzymfamiler

Kompetencer:

• Forholde sig kritisk til valg af og brug af digitale værktøjer baseret på en forståelse af de grundlæggende principper bag bioinformatik
• Forholde sig kritisk til input og output af data og resultater opnået ved brug af bioinformatiske metoder, herunder refleksion over tilgang til data, valg af digitale værktøjer og genereret data
• Skal kunne udvælge metoder for at analysere givne data og finde bioteknologiske løsninger