Bioorganisk Kemi

Formålet med kurset er at give en grundlæggende forståelse for bioorganisk kemi med sigte på medicinalkemi.

Kurset introducerer grundlæggende bioorganiske begreber med fokus på bioorganiske forbindelsers struktur, funktion og reaktivitet. Kurset fokuserer på peptider, proteiner, kulhydrater, oligonukleotider, samt naturprodukter. Struktur, konformation og foldning af peptider, kulhydrater, oligonukleotider gennemgås. Der gives en gennemgang af de fysisk-kemiske egenskaber for forskellige stofklasser samt deres molekylære vekselvirkninger med targets, f.eks. receptorer. Der gives en introduktion til peptid-hormoners funktion og til simple kulhydratstrukturers glykobiologi.

Udvalgte naturprodukter vil blive gennemgået, herunder polyketider og alkaloider, samt penicillin, med paclitaxel og morfin som eksempler

Den kemiske syntese af peptider, oligonukleotider samt oligosakkarider introduceres, herunder fastfase-syntese af peptider og oligonukleotider, samt beskyttelsesgruppekemi og glykosyleringsreaktioner til syntesen af oligosakkarider. Metoder til chemoselektiv modifikation af proteiner beskrives. Semi-syntesen af udvalgte naturprodukter gennemgås.

Udvalgte eksempler på brugen af peptider, oligonukleotider, kulhydrater og naturprodukter i medicinalkemi vil blive gennemgået, herunder syntetiske oligonukleotid-primere til PCR. Eksempler på succesrige lægemidler, herunder peptid-baserede, vil blive præsenteret.

Pensum eksemplificeres med et antal cases fra bioorganisk kemi og kemisk biologi.