Naturressourcers organiske kemi

Formålet med kurset er at give en grundlæggende forståelse for organisk kemi og nogle spektroskopiske metoder af betydning for naturressourcer og udgøre et fundament for videre studier indenfor området.

Kurset introducerer grundlæggende organisk-kemiske begreber med fokus på emner af relevans for forståelse af organiske forbindelsers struktur og reaktivitet. Dette inkluderer organiske forbindelsers molekylstruktur, beskrivelser af orbitaler i organisk kemi, navngivning og udvalgte kemiske reaktioner såsom addition, substitution og elimination, nucleofil acyl-substitution, elektrofil aromatisk substitution, aldolreaktioner, mm. Der gives en gennemgang af de fysisk-kemiske egenskaber for funktionelle stofklasser (alkaner, cycloalkaner, alkener, alkyner og aromatiske forbindelser, alkylhalider, alkoholer, ethere, thioler, aldehyder, ketoner, carboxylsyrer, estre og amider), med det sigte at forstå deres rolle i vigtige molekyler såsom aminosyrer, peptider, proteiner, kulhydrater, og lipider.

Der gives en introduktion til beskrivelsen af reaktioners kinetik og termodynamik. Stereokemi og-repræsentationer omfattende E/Z-, R/S- og D/L-nomenklatur, Fischer- og Newman-projektioner, samt 'zig-zag'-repræsentation (aminosyrer) vil blive beskrevet. Optisk aktivitet bliver introduceret. Kvalitative analytiske og spektroskopiske metoder til karakterisering af organisk molekylers struktur vil være en integreret del af undervisningen, med en fokus på NMR- og massespektroskopi.

Pensum eksemplificeres med et antal cases fra plantebiologi og miljøkemi, såsom signalering i bælgplanter, cykliske peptider i planter og enkelte pesticiders kemi.