Biokemi for bioinformatikere
Kursusindhold
De basale træk af biokemien behandles. Emnerne er biomolekyler (proteiner og nukleinsyrer) og lavmolekylære forbindelsers (metabolitters) struktur og basale kemiske egenskaber, og deres relation til cellebiologi. Kurset indeholder en introduktion til basale koncepter i kemisk termodynamik og kinetik, og i elementer af interaktioner mellem biomolekyler, med mål mod at anvende disse emner i bioinformatik.
Biochemistry for Bioinformaticians
Bacheloruddannelsen i bioinformatik
Viden:
- Beskrive proteiners og nukleinsyrers grundlæggende kemiske opbygning samt deres overordnede kemiske struktur, funktion og egenskaber
- Beskrive centrale kemiske reaktioner, der er relevante i den centrale metabolisme
- Kende til centrale metabolitter
- Have en basal forståelse for enzymers egenskaber
- Have en basal forståelse for kemisk termodynamik og kinetik
- Kende til principperne bag molekylære interaktioner (protein–protein og protein–nukleinsyre)
- Kendskab til den molekylære basis for klassifikation af proteinstrukturer herunder motiver, super-sekundære strukturer, fold, domæner og moduler
- Redegøre for kinetik og –termodynamik i relation til enzymfunktion og proteinstabilitet
- Kende til aminosyrernes basale kemi
- Kende til sekundære og tertiære strukturer
- Kendskab til metoder til at forudsige proteinstrukturer
Færdigheder:
- Udvise overblik over den centrale metabolisme
- Kunne beskrive og forklare sammenhængen mellem DNA og protein sekvenser og biologiske funktioner i kontekst af typiske bioinformatiske problemstillinger
- Udføre basale beregninger indenfor kinetik og termodynamik
- Anvende viden om aminosyrernes kemi til at beskrive proteiners sekundære og tertiære struktur
- Demonstrere forståelse af proteinstrukturer og interaktion, herunder intermolekylære kræfter
Kompetencer:
- Referere og kommunikere kursets emner med andre fagprofessionelle
- Diskutere, evaluere og perspektivere problemstillinger af
biokemisk karakter i relation til bioinformatik som emne
Forelæsninger, teoretiske øvelser og praktiske (computer)øvelser
Se Absalon
Kurset er tilrettelagt under den forudsætning, at de studerende sideløbende følger de øvrige obligatoriske kurser. Det antages at de studerende har fulgt kurset i Grundlæggende biovidenskab.
- ECTS
- 7,5 ECTS
- Prøveform
-
Mundtlig prøve, 20 minutter (ingen forberedelse)
- Prøveformsdetaljer
- Mundtlig prøve på 20 minutter (herudover votering og karaktergivning) uden forberedelse, baseret på prædefinerede spørgsmål indenfor kursets emner.
- Hjælpemidler
- Uden hjælpemidler
- Bedømmelsesform
- 7-trins skala
- Censurform
- Ingen ekstern censur
- Reeksamen
-
Samme som ordinær eksamen
Kriterier for bedømmelse
For at opnå karakteren 12, skal den studerende overbevisende og præcist kunne demonstrere viden, færdigheder og kompetencer som beskrevet under målbeskrivelsen.
- Kategori
- Timer
- Forelæsninger
- 16
- Forberedelse (anslået)
- 144
- Teoretiske øvelser
- 24
- Praktiske øvelser
- 8
- Eksamensforberedelse
- 14
- Eksamen
- 0
- Total
- 206
Kursusinformation
- Undervisningssprog
- Dansk
- Kursusnummer
- NBIB24003U
- ECTS
- 7,5 ECTS
- Niveau
- Bachelor
- Varighed
-
1 blok
- Placering
- Blok 2
- Skemagruppe
-
A (tirs 8-12 + tors 8-17)
- Kapacitet
- 40
Der kan være færre pladser, hvis du tilmelder dig i eftertilmeldingsperioden (BA og KA) eller som merit- eller enkeltfagsstuderende. - Studienævn
- Studienævn for det Biologiske Område
Udbydende institut
- Biologisk Institut
Udbydende fakultet
- Det Natur- og Biovidenskabelige Fakultet
Kursusansvarlig
- Kresten Lindorff-Larsen (8-7471766c777a6e6e486a717736737d366c73)
Underviser
Kresten Lindorff-Larsen
Sine Lo Svenningsen
Jakob R Winther
Birthe B Kragelund
Kaare Teilum
Are you BA- or KA-student?
Courseinformation of students