Molekylær økologi

Kurset vil give den studerende teoretisk og praktisk viden om populationsgenetiske tilgange til økologiske problemstillinger. Herunder anvendelse af forskellige statistiske metoder. Gennem praktiske øvelser vil den studerende desuden få færdigheder i at anvende metoderne på diverse typer af molekylære data.

Efter endt kursus har den studerende:

Viden:

• Genetiske markører og deres molekylære baggrund
• Populationsstruktur og populationsdifferentiering
• Gængse statistiske metoder og deres anvendelse
• Betydning af istidsrefugier for recent populationsstruktur
• Coalescens teori
   

Færdigheder:

• Downloade sekvens datasæt og håndtere de mest almindelige dataformater: fasta, phylip, nexus
• Foretage og forstå alignment af sekvenser og lave og tolke fylogenetiske træer som NJ, Maximum Likelihood og Baysian baseret fylogeni
• Downloade og håndtere snp og Microsatellit datasæt
• Anvende molekylære data i populationsgenetiske analyser af gen diversitet, nucleotid diversitet,  bestemmelse af effektiv populationstørrelse og koblingsuligevægt
• Anvende molekylære data til analyse af populationsstruktur og populationsblandinger, beregning af genetiske afstande, migration og gen-flow
• Anvende molekylære data og software til at besvare fylogeografiske og demografiske problemstillinger.  
   

Kompetencer:

• Foretage kritisk analyse af nyere litteratur indenfor molekylær økologi
• Vurdere metodevalg til analyse og økologiske og populationsgenetiske spørgsmål
• Præsentere resultater af molekylære analyser